Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDE4CQ08493 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDE4CQ08493 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDE4CQ08493 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms