Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 YPL162CYPL162C 822 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 HOF1YMR032W 2010 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 YDL109CYDL109C 1944 nt5.86□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 HXT4YHR092C 1731 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 MET7YOR241W 1647 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 THI2YBR240C 1353 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 RDI1YDL135C 609 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 IRC22YEL001C 678 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 DOG2YHR043C 741 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 DOG1YHR044C 741 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 RPP1YHR062C 882 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 PFS1YHR185C 714 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 RUF22RUF22 515 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 YNG1YOR064C 660 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 TMA16YOR252W 537 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 YBR063CYBR063C 1215 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 ICS2YBR157C 768 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 SRB6YBR253W 366 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 SPC97YHR172W 2472 nt5.85□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 MSY1YPL097W 1479 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 GIP1YBR045C 1920 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 COM2YER130C 1332 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 VPS4YPR173C 1314 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 HSP42YDR171W 1128 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 LYS1YIR034C 1122 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 VPS25YJR102C 609 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 YBL096CYBL096C 309 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 SCD6YPR129W 1050 nt5.84□□□□□ -1.47
HDA2Q06629 CCT8YJL008C 1707 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 PEX3YDR329C 1326 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 PRP24YMR268C 1335 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 KTR6YPL053C 1341 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 VMA3YEL027W 483 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 MTC7YEL033W 420 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YGR016WYGR016W 573 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YAL069WYAL069W 315 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 COX5AYNL052W 462 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 VMA4YOR332W 702 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CTF19YPL018W 1110 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YBR053CYBR053C 1077 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CCL1YPR025C 1182 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SPP381YBR152W 876 nt5.83□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YDR056CYDR056C 618 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YDR187CYDR187C 519 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YER085CYER085C 522 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CWC23YGL128C 852 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YGL185CYGL185C 1140 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 AIM18YHR198C 966 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 IME1YJR094C 1083 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SRP21YKL122C 504 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SHE1YBL031W 1017 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 BUD17YNR027W 954 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CUP9YPL177C 921 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 snR44snR44 211 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SGF29YCL010C 780 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CDC1YDR182W 1476 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SAG1YJR004C 1953 nt5.82□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SPO1YNL012W 1896 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YTM1YOR272W 1383 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YMD8YML038C 1329 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 MPP10YJR002W 1782 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YDL016CYDL016C 303 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 RPT3YDR394W 1287 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 MF(ALPHA)2YGL089C 363 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CUP2YGL166W 678 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 AIM24YJR080C 1185 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YLR463CYLR463C 552 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YNL050CYNL050C 813 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 TYE7YOR344C 876 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 GRE1YPL223C 507 nt5.81□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 PMT5YDL093W 2232 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 OSW2YLR054C 2175 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 ALT2YDR111C 1524 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 SKS1YPL026C 1509 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YEH1YLL012W 1722 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 MDM38YOL027C 1722 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YGR054WYGR054W 1929 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 ARE2YNR019W 1929 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 COQ4YDR204W 1008 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 RPL12AYEL054C 498 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 PRE1YER012W 597 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YGR026WYGR026W 837 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 PRP38YGR075C 729 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 AIM19YIL087C 474 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 MDE1YJR024C 735 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YLR456WYLR456W 615 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 AIM33YML087C 939 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 TRM10YOL093W 882 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 USV1YPL230W 1176 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 TRP5YGL026C 2124 nt5.8□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 FOB1YDR110W 1701 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YFL040WYFL040W 1623 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YLR123CYLR123C 330 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YLR462WYLR462W 609 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 PRE7YBL041W 726 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 CYC2YOR037W 1101 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 YPR202WYPR202W 717 nt5.79□□□□□ -1.48
HDA2Q06629 TAE1YBR261C 699 nt5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.4 ms