Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABPAQ06546 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABPAQ06546 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GABPAQ06546 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms