Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC18A2Q05940 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC18A2Q05940 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms