Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNB3Q05901 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHRNB3Q05901 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHRNB3Q05901 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 465.4 ms