Protein–RNA interactions for Protein: Q05066

SRY, Sex-determining region Y protein, humanhuman

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRYQ05066 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SRYQ05066 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SRYQ05066 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SRYQ05066 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SRYQ05066 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SRYQ05066 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SRYQ05066 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SRYQ05066 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SRYQ05066 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SRYQ05066 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms