Protein–RNA interactions for Protein: Q03164

KMT2A, Histone-lysine N-methyltransferase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 3,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KMT2AQ03164 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
KMT2AQ03164 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KMT2AQ03164 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms