Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CAV1Q03135 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CAV1Q03135 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CAV1Q03135 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms