Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GCNT1Q02742 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GCNT1Q02742 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms