Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ID3Q02535 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ID3Q02535 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ID3Q02535 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ID3Q02535 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ID3Q02535 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ID3Q02535 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ID3Q02535 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ID3Q02535 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ID3Q02535 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ID3Q02535 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ID3Q02535 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ID3Q02535 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ID3Q02535 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ID3Q02535 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ID3Q02535 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms