Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFRSF17Q02223 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFRSF17Q02223 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms