Protein–RNA interactions for Protein: Q01201

RELB, Transcription factor RelB, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELBQ01201 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RELBQ01201 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RELBQ01201 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RELBQ01201 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RELBQ01201 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RELBQ01201 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RELBQ01201 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RELBQ01201 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RELBQ01201 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELBQ01201 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELBQ01201 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RELBQ01201 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RELBQ01201 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RELBQ01201 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RELBQ01201 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RELBQ01201 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RELBQ01201 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RELBQ01201 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms