Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SPTBN1Q01082 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms