Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRCDQ00LT1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRCDQ00LT1 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms