Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CDK6Q00534 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CDK6Q00534 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CDK6Q00534 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms