Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDKL1Q00532 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDKL1Q00532 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms