Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CBX1P83916 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CBX1P83916 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CBX1P83916 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CBX1P83916 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CBX1P83916 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CBX1P83916 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX1P83916 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX1P83916 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX1P83916 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX1P83916 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CBX1P83916 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CBX1P83916 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX1P83916 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX1P83916 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX1P83916 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CBX1P83916 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX1P83916 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CBX1P83916 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CBX1P83916 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CBX1P83916 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms