Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PRAMEP78395 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRAMEP78395 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms