Protein–RNA interactions for Protein: P78385

KRT83, Keratin, type II cuticular Hb3, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT83P78385 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT83P78385 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KRT83P78385 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRT83P78385 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KRT83P78385 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRT83P78385 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KRT83P78385 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KRT83P78385 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KRT83P78385 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KRT83P78385 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KRT83P78385 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KRT83P78385 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KRT83P78385 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms