Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SH3BP2P78314 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SH3BP2P78314 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SH3BP2P78314 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
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