Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HBBP68871 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HBBP68871 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HBBP68871 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HBBP68871 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HBBP68871 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HBBP68871 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HBBP68871 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HBBP68871 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
HBBP68871 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HBBP68871 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HBBP68871 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms