Protein–RNA interactions for Protein: P63244

RACK1, Receptor of activated protein C kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RACK1P63244 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RACK1P63244 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RACK1P63244 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RACK1P63244 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RACK1P63244 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RACK1P63244 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RACK1P63244 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RACK1P63244 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RACK1P63244 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RACK1P63244 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RACK1P63244 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RACK1P63244 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RACK1P63244 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms