Protein–RNA interactions for Protein: P63124

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P63124 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERV-K104P63124 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HERV-K104P63124 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms