Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRA2BP62995 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRA2BP62995 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRA2BP62995 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRA2BP62995 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRA2BP62995 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRA2BP62995 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRA2BP62995 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRA2BP62995 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRA2BP62995 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRA2BP62995 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRA2BP62995 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRA2BP62995 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRA2BP62995 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRA2BP62995 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms