Protein–RNA interactions for Protein: P62875

POLR2L, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2LP62875 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
POLR2LP62875 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
POLR2LP62875 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
POLR2LP62875 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms