Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SNRPD1P62314 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNRPD1P62314 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNRPD1P62314 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms