Protein–RNA interactions for Protein: P61956

SUMO2, Small ubiquitin-related modifier 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO2P61956 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SUMO2P61956 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SUMO2P61956 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms