Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ERVK11-1P61568 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms