Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3EP60228 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms