Protein–RNA interactions for Protein: P59646

FXYD4, FXYD domain-containing ion transport regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXYD4P59646 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FXYD4P59646 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FXYD4P59646 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms