Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SNX16P57768 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SNX16P57768 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SNX16P57768 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX16P57768 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX16P57768 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX16P57768 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX16P57768 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SNX16P57768 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX16P57768 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX16P57768 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX16P57768 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX16P57768 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SNX16P57768 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SNX16P57768 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SNX16P57768 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SNX16P57768 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SNX16P57768 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SNX16P57768 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SNX16P57768 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms