Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLDN2P57739 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLDN2P57739 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLDN2P57739 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms