Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GEMIN4P57678 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GEMIN4P57678 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GEMIN4P57678 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms