Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBASH3AP57075 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBASH3AP57075 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBASH3AP57075 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms