Protein–RNA interactions for Protein: P57060

RWDD2B, RWD domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2BP57060 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RWDD2BP57060 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RWDD2BP57060 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RWDD2BP57060 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms