Protein–RNA interactions for Protein: P56704

WNT3A, Protein Wnt-3a, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT3AP56704 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
WNT3AP56704 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WNT3AP56704 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms