Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA1P56199 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITGA1P56199 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms