Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SEC13P55735 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC13P55735 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SEC13P55735 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC13P55735 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC13P55735 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC13P55735 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC13P55735 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC13P55735 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC13P55735 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC13P55735 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC13P55735 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC13P55735 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC13P55735 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC13P55735 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SEC13P55735 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC13P55735 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SEC13P55735 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC13P55735 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC13P55735 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC13P55735 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC13P55735 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC13P55735 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC13P55735 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms