Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH13P55290 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH13P55290 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH13P55290 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH13P55290 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH13P55290 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH13P55290 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH13P55290 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH13P55290 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH13P55290 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH13P55290 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH13P55290 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH13P55290 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms