Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BRPF1P55201 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BRPF1P55201 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
BRPF1P55201 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms