Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ATXN1P54253 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATXN1P54253 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms