Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LIMK2P53671 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LIMK2P53671 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LIMK2P53671 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms