Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPAP53621 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPAP53621 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPAP53621 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
COPAP53621 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COPAP53621 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COPAP53621 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPAP53621 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPAP53621 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPAP53621 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
COPAP53621 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPAP53621 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPAP53621 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPAP53621 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPAP53621 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
COPAP53621 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COPAP53621 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COPAP53621 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COPAP53621 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms