Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARFIP1P53367 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFIP1P53367 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP1P53367 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms