Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GBX2P52951 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GBX2P52951 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GBX2P52951 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GBX2P52951 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GBX2P52951 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GBX2P52951 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GBX2P52951 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms