Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ZNF138P52744 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ZNF138P52744 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms