Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCNN1GP51170 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNN1GP51170 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNN1GP51170 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms