Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB27AP51159 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB27AP51159 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB27AP51159 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms