Protein–RNA interactions for Protein: P50895

BCAM, Basal cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAMP50895 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BCAMP50895 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAMP50895 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAMP50895 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAMP50895 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BCAMP50895 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
BCAMP50895 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.57■■■□□ 2
BCAMP50895 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
BCAMP50895 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
BCAMP50895 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
BCAMP50895 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
BCAMP50895 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BCAMP50895 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCAMP50895 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BCAMP50895 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BCAMP50895 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BCAMP50895 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.52■■■□□ 2
BCAMP50895 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
BCAMP50895 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BCAMP50895 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BCAMP50895 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms