Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERFP50548 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERFP50548 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
ERFP50548 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERFP50548 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERFP50548 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERFP50548 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERFP50548 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERFP50548 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERFP50548 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERFP50548 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERFP50548 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERFP50548 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERFP50548 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERFP50548 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERFP50548 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERFP50548 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERFP50548 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERFP50548 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERFP50548 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms